并且建立商氏族谱，将商毅和叶瑶瑱的名字也填写在上面，这也像征商氏的宗庙正式成立。

    拜神祭祖之后，商毅和叶瑶瑱由午门进入紫禁城，在太和殿上等候，而在承天门外的大臣们也都依次列队，进入皇宫，商毅在太和殿上居中正座，接受众官员们的参拜，众官员们向商毅行三拜九叩大礼，齐呼三声万岁。然后由王夫之当众朗读建国诏书，以及国号、年号等等，这也表示中华帝国正式成立。

    随后商毅又接受了皇帝之宝，皇帝信宝，制诰之宝这三块玉玺，同时正式策封叶瑶瑱为皇后，叶瑶瑱向商毅拜谢之后，接受了皇后的宝、印、册，然后和商毅并肩而坐，接受众官员们的贺拜，并且对官员们进行封赏。整个称帝仪式的第二阶段也结束了。